育苗穴盘的穴孔形状主要有方形和圆形,方形穴孔所含基质一般要比圆形穴孔多30%左右,水分分布亦较均匀,种苗根系发育更加充分。标准穴盘的尺寸为540mm×280mm,因穴孔直径大小不同,孔穴数在18-800之间。栽培中、小型种苗,以72--288孔穴盘为宜。
育苗穴盘的颜色会影响植物根部的温度。白色的聚苯泡沫盘反光性较好,多用于夏季和秋季提早育苗,以利反射光线,减少小苗根部热量积聚。而冬季和春季选择黑色育苗盘,因其吸光性好,对小苗根系发青有利。苗木长大后,就应开始使用控根快速育苗技术,移入控根快速育苗容器内,继续生长。